（一）办公室（信访办公室）（二）组织人事处（三）法规处（区县指导处）（四）财务处（五）安全监督处（六）客运处（轨道交通处）（七）货运处（静态交通处）（八）港务监管处（九）航务监管处（十）引航管理处（十一）综合规划建设处（十二）交通保障协调处（十三）科技信息处（十四）合作交流处（十五）洋山港区管理办公室（十六）空港地区管理处