山东农业大学一本专业有：农学、植物科学与技术、植物保护、制药工程（农药方向）、动植物检疫（植检方向）、烟草、森林保护（有害生物防控方向）、森林保护（菌物资源与利用方向）、生物技术、生物工程、生物科学。

山东农业大学最好的专业是农学和动物科学。应该说山东农业大学最有影响力的专业是农学和动物科学。

除此之外，山东农业大学二本专业有：计算机科学与技术、计算机科学与技术（惠普软件开发方向）、计算机科学与技术（惠普软件测试方向）、网络工程、信息与计算科学、国际经济与贸易（中德项目）、工商管理（中德项目）、会计学（中德项目）等。