总共分5部，1~4部完结，第5部目前正在连载。

第一部：《游戏王朝日版》全27集，主角武藤游戏（剧场版为《真红眼黑龙》）

第二部：《游戏王DM》全224集，主角武藤游戏（剧场版为《光之金字塔》）

第三部：《游戏王GX》全180集，主角游城十代（无剧场版）

第四部：《游戏王5DS》全154集，主角不动游星（剧场版为《超融合！超时空的羁绊》）

第五部：《游戏王ZEXAL》现在更新至12集，主角九十九游马（目前无剧场版）