丹麦腓特烈九世是弗雷德里克，是格吕克斯堡家族的一员，他是丹麦国王克里斯蒂安十世和梅克伦堡-什未林的亚历山德琳·奥古斯特女公爵的长子。当他的父亲于1912年继承了丹麦王位后，弗雷德里克便成为了丹麦王储。弗雷德里克年轻时曾在丹麦皇家海军学院接受教育。1935年，弗雷德里克与瑞典的英格丽德公主结婚，他们育有三女。1942年到1943年期间，弗雷德里克成为了丹麦的摄政王。