南京航空航天大学和南京理工大学的专业侧重是不一样的。关键看你想考什么专业的。

南京航空航天大学的国家重点学科包括航空宇航科学与技术 、飞行器设计、航空宇航推进理论与工程、航空宇航制造工程、人机环境与工程、力学、 一般力学与力学基础、固体力学、流体力学、工程力学、机械制造及其自动化、导航、制导与控制（培育）、电力电子与电力传动（培育）。

南京理工大学的国家重点学科包括武器系统与运用工程、兵器发射理论与技术、火炮、自动武器与弹药工程、军事化学与烟火技术、光学工程、材料学、电磁场与微波技术、应用化学、模式识别与智能系统。

都挺难考，关键看你自己是不是足够努力。