二者不是一回事。

中国科学院生态环境研究中心为国务院批准成立的中国科学院环境化学研究所，两者为隶属关系。

中国科学院生态环境研究中心始建于1975年，时为国务院批准成立的中国科学院环境化学研究所，是全国性生态环境领域综合性研究机构，隶属于中国科学院管辖。

中国环境科学研究院围绕国家可持续发展战略，开展创新性、基础性重大环境保护科学研究，致力于为国家经济社会发展和环境决策提供战略性、前瞻性和全局性的科技支撑，服务于经济社会发展中重大环境问题的工程技术与咨询需要。