主要剧情：《仙剑奇侠传三外传》以三代中紫萱设计徐长卿的锁妖塔事件为引子而展开；连接前代的人物纷纷登场；蜀山的天道使命与责任也逐渐呈现。 由于未知的原因导致蜀山仙境开始崩坏，地脉门户大开。

前往探查的蜀山长老及弟子，被地脉中抵克蜀山仙术的瘴气化去功力，苦战不敌妖众，悉数殒命。

掌门徐长卿临危授命，责令自小长在蜀山却一直未被收入门下的少年--南宫煌，携带书信前往绿萝山， 求助于掌握蜀山秘宝五灵轮的清冷仙人。

清冷仙人遂收南宫煌入绿萝门下，并将五灵轮与之身合，开启地脉入口，疏通五灵，从而使蜀山"否极泰来"、回复混沌状态。

地脉之旅就此启程。 同时，随父从军被室韦国王看中选为和亲对象的大力女温慧，为了逃婚，来到和母亲有莫名渊源的蜀山，和无意中救下的乖巧女孩儿王蓬絮一起加入了南宫煌的队伍。

在旅程中，他们又结识了身中剧毒的里蜀山少主星璇、勾魂失败滞留人间的鬼差雷元戈。

在错综的因缘和利益关系中，究竟是谁在操纵和主导着蜀山的命运？亲情、友情、爱情的抉择中，什么才是真正的获得，随着交错的阴谋与秘密的解开，南宫煌一行人也认识到自己的人生价值、方向和追求。