中国科学技术大学控制的上市公司为科大创新（科大创新股份有限公司,600551.SH）。

科大创新股份有限公司是经安徽省人民政府批准，由中国科学技术大学科技实业总公司作为主发起人，以发起设立方式于1999年12月12日成立的股份有限公司，注册资本7500万元。公司位于合肥高新技术产业开发区，是经安徽省科委认定的高新技术企业。2000年通过了国家科技部、中科院“双高”论证。2002年科大创新在上海证券交易所挂牌上市，股票代码600551。