1、两者的区别是：一、生产原料不同。
2、生物柴油主要使用含油脂植物（亚麻、玉米等）作为原料生产柴油；石化柴油的生产原料就是地下开采的原油；二、生产技术工艺不同；石化柴油采用炼制技术，植物柴油则不是；三、生产成本有所差异。
3、一般来说，生物柴油成本高于石化柴油。
4、另外，生物柴油在我国并未推广使用。