你公司属于协作单位，拨款单位属于科研项目主承担单位，你们之间的经费拨款使用应有《项目任务合同书》为支持依据。

科研单位拨入的科研协作经费，属于专项经费，在专项应付款-**项目科目列支，在资产方列支研发成本-**项目（与专项应付款二级科目对应）列支支出，研发结束还须有专项审计，审计后，依据审计报告开发成本和专项应付款科目对转。

收到科研经费如属于上述情况，无需开具发票，因不属于经营。

如科研单位委托做莫种实验，化验等类似性质业务，拨款，属于经营就需开具发票。重要的是判定经费性质。