1、藿香正气水的副作用有全身性损害。
2、神经和精神系统损害。
3、心血管系统损害：心跳加速、胸闷、紫绀、心悸、心动过速。
4、皮肤及其附件损害。
5、消化系统损害。
6、呼吸系统损害：呼吸急促、气喘、憋气、呼吸困难。
7、视觉损害：如视物不清、结膜充血。