增值税发票选择确认平台撤销已勾选的发票方法如下：

1、打开增值税勾选确认平台，点击勾选的所属期。

2、进入所属期界面之后，选择开票的日期，日期一定要选择到之前提交勾选的时间。

3、日期选择好之后，勾选状态，选择全部，这是重点，之后点击界面右上角的查询。

4、点击查询之后，页面会弹出所有的进项发票，之前勾选的进项发票，前面会有一个勾的状态。

5、把最前面的勾去掉，然后选择需要勾选的发票。

6、选择好最终需要认证的进项发票之后，点击页面最下方的保存，就可以把之前已经勾选的发票给撤销了。