为了回答问题，先将该诗转录如下：

《赠花卿》

唐～杜甫

锦城丝管日纷纷，半入江风半入云。

此曲只应天上有，人间能得几回闻。

题主你已经用搜韵软件查找出来杜甫《赠花卿》一诗的韵脚：纷 云 闻 同属于《平水韵》十二文韵部：

却又提出：该诗第二句为何不与第一，第四句押韵？你的理由是：本人写诗习惯用普通话四声韵。既然你写诗用汉语拼音四声韵，杜甫《赠花卿》一诗的韵脚：纷 闻 云也同属《中华新韵》的九文韵部。

哪，你为何会感觉该诗第二句不与第一，四句押韵？我分析，你是把第二句韵脚云的韵母un，与第一，四句韵脚纷 闻的韵母en就行比较后，感觉第二句与一，四句韵脚的韵母不一样，怎么会押韵啊？！

是啊，韵母un与韵母en的字怎么会划分在一个韵部？这只能找编制《平水韵》，《中华新韵》的人。我们作诗押韵只能照此办理。

如果究其所以然，我粗浅的认知是：韵母是由韵首 韵腹 韵尾组成。同一韵部的字一般是韵尾一样，如云的韵母un,韵腹是u,韵尾是n ; 纷，闻的韵母是en，它们的韵腹都是e,韵尾都是n。虽然，云 纷 闻的韵腹不同，但，它们的韵尾都是n。当然，不仅韵尾要相同，韵腹也要基本相同。是否韵尾相同，韵腹也基本相同的字就可以划在一个韵部？不是的！还要根据这个字的声调，平 上 入划分三个部。也就是把韵尾相同，韵腹基本相同的字划为一组，再按照字的音调划分为三部。这也就是写近体诗，为什么要用《平水韵》韵书。106个韵部，9800多个字，搁谁，谁也记不住。至于《中华新韵》基本与汉语拼音吻合，所以，逐步被诗词爱好者接受。

综上所述，题主的第一个问题就基本明确了，就是不能简单的用汉语拼音的韵母是否一致，判断韵脚是否押同一个韵部。

至于题主的第二个问题：此诗妙在何处？只要会百度的人，都可以查找到答案：就是借诗劝谕花卿（花敬定）不要居功自傲，僭越礼制，唐的礼乐按等级划分，有严格规定。从诗中可以看出花卿是僭越了：此曲只应天上有，人间能得几回闻。第二个问题就无需再展开赘言了。

希望我的回答能帮你解开困惑。